В рамках исполнения полномочий, согласно Устава, в соответствии области аккредитации испытательной лаборатории и лицензируемых видов деятельности структурных подразделений Учреждение проводило работу по направлениям: ветеринария, включая государственный эпизоотический мониторинг,  карантин растений, семеноводство, качество и безопасность зерна и продуктов его переработки,   государственный мониторинг зерна (гречиха), агрохимия и плодородие почв, безопасное обращение с пестицидами, фитосанитарное обеззараживание подкарантинной продукции и подкарантинных объектов, сертификации продукции (консультирование), классификации средств размещения, в качестве органа инспекции.
За 11 месяцев 2022 года в испытательной лаборатории Учреждения проведено 120872 исследований в 56616 пробах, выявлено 23445 положительных результатов (19,4%). В рамках государственного задания проведено 10110 исследований, выявлено 1125 положительных результатов (11,1%).  Помимо преобладающих выявлений (КМАФАнМ, БГКП, ЖКС, ДНК, листерия, микотоксины), было установлено наличие макроциклических лактонов, антибиотиков хиноксолинового и пенициллинового ряда в различного рода пищевой продукции, недопустимый уровень поствакцинальных антител к вирусу классической чумы свиней в сыворотке крови свиней.
В течение года в Учреждении дважды проводились процедуры подтверждения компетентности на соответствие стандартов 17025-2019 ИЛ и 17020-2012 ОИ с положительным результатом. Высокий уровень компетентности наших специалистов подтверждается и пройдёнными МСИ, организованными национальными провайдерами: 30 раундов на 165 исследований (энтомология, микология, вирусология, гербология, ГМО, ДНК, токсичные элементы, пестициды, микотоксины, агрохимические показатели почв, качества зерна). Все это является результатом особого внимания Учреждения к повышению квалификации специалистов: с целью получения новых профессиональных компетенций 32 сотрудника ФГБУ прошли обучение и получили соответствующие удостоверения. 
По итогам работы органа инспекции выдано 15049 экспертных заключений, 616 актов инспекции. Отделом сертификации оказано 915 услуг по подготовке и оформлению пакета документов для регистрации деклараций соответствия ТР ТС и ТС ЕЭС.
Отделом фумигации с начала года проведены работы по фитосанитарному обеззараживанию помещений - 270,2 тыс.м3, лесопродукции - 338 м3, зерновой продукции (на экспорт) - 60,3 тыс.тонн, плодоовощной продукции - 154,5 тонн. Специалистами отдела проводятся работы по пест-контролю на Забайкальском зерновом терминале, первом в мире сухопутном объекте зерновой логистики полного цикла.  Заключены договоры на комплексное обслуживание. 
Существенный объем работ произведен на объекте капитального строительства здания ФГБУ «Забайкальский референтный центр Россельхознадзора» в целях размещения лабораторного блока (корпуса) соответствующего уровня биологической защиты для работы с возбудителями АЧС и иными особо опасными болезнями животных. Проводится чистовая отделка, завершается инсталляция технического оборудования. Срок ввода объекта  в эксплуатацию – 2023 год.